Το όνομα του νησιού κατά την αρχαιότητα ήταν ΥΕΤΟΥΣΣΑ. Ο ιστορικός Θουκιδίδης και ο γεωγράφος Στράβων το ονόμαζαν ΤΡΑΓΑΙΑ / ΤΡΑΓΑΙΑΙ. Το όνομα “Αγαθονήσι” το οφείλει στους κατοίκους του, οι οποίοι είναι καλοί (αγαθοί) άνθρωποι. Κατά τα αρχαία χρόνια το νησί κατοικήθηκε από Δωριείς και αργότερα από Ίωνες (υπάρχουν οικοδομικά ερείπια που χρονολογούνται από αυτή την περίοδο). Εδώ γεννήθηκε ο φιλόσοφος Θεόγητος ο Τραγαιώτης, ο οποίος ήταν μαθητής του Αριστοτέλη. Το Αγαθονήσι δωρήθηκε στη Μονή Πάτμου στα τέλη του 13ου αιώνα από τον βυζαντινό αυτοκράτορα. Γενικά το νησί ακολούθησε τη μοίρα των άλλων Δωδεκανήσων (τουρκική και ιταλική κυριαρχία) και επανενώθηκε το 1948 με τη μητέρα Ελλάδα.
Κλίμα: Είναι ξηρό, με ήπιους χειμώνες και δροσερά καλοκαίρια.
Γεύσεις: Εκτός από τα θαλασσινά, θα πρέπει να δοκιμάσετε το αρνί ή το κατσίκι του νησιού, τα οποία είναι ελευθέρας βοσκής.